Az eMule beallitasa soran eloszor azt kell szem elott tartanod, hogy csak jogtisztan terjesztheto tartalmak megosztasara es letoltesere hasznald a programot. A telepites utan inditsd el az alkalmazast, es kovessed a kezdo beallito varazslot, ahol megadhatod a felhasznalonevedet, a hallgatos portokat es az alapveto kapcsolat tipusat. Fontos, hogy a tuzfalon es az esetleges routeren is engedelyezd az eMule altal hasznalt portokat, kulonben a kapcsolat korlatozott lesz.
A beallitasok menuben finomhangolhatod a savszelesseg korlatozasait, hogy a letoltes es a feltoltes ne foglalja le teljesen az internet kapcsolatot. Valaszthatsz szervereket vagy Kad halozatot is, attol fuggoen, milyen modon szeretnel csatlakozni a felhasznalokhoz. Ugyelj arra, hogy keruld az ismeretlen, megbizhatatlan forrasbol szarmazo szerverlistakat, mert ezek rossz minosegu vagy akar karos tartalmakhoz is vezethetnek.
A program hasznalata soran rendezd a letolteseket konyvtarakba, es torold azokat a fajlokat, amelyekrol kiderul, hogy hibasak vagy nem az elvart tartalmat tartalmazzak. Idorol idore frissitsd az eMule valtozatat, hogy a hibajavitások es esetleges biztonsagi frissitesek ervenyesuljenek. A felelos hasznalat es a jogi eloirasok tiszteletben tartasa mellett az eMule praktikus eszkoz lehet nagyobb fajlok megosztasara a kozosseg tagjai kozott.